美國是一個由多民族組成的國家，但在歷史很長時間，白人在美國處於壟斷性的領導地位，他們甚至會無理剝削其他種族（特別是黑人）的權益，種族隔離政策在美國奉行了一段很長時間。甘迺迪總統知道隨着時代進步，種族隔離主義已經是落伍的思想，作為美國總統，他有責任修正和教育國民，讓不同種族國民都能夠為國家效力。甘迺迪當政的年代主流民意是白人至上，尤其是南方地區，甘迺迪要改變人們根深蒂固的觀念並不容易，他實行種族平權，必定會讓他損失不少來自南方的選票。
作為出色的領袖，甘迺迪將國家利益置於個人利益之上，他在短短一屆任期，就為美國黑人平權之路踏前一大步。在60年代前，美國不少大學都只會取錄白人學生，黑人連基本上學權利也沒有。但隨着歷屆總統的努力，各州大學都開始放寬這規定，唯獨位於南方的阿拉巴馬大學一直堅持着只取錄白人學生。阿拉巴馬大學之所以態度強硬是因為它所在位置處於白人主義盛行的阿拉巴馬州，當地州長喬治華萊士更加是隔離主義的死硬派。他曾經公開說：「如果有一天，有人想干預阿拉巴馬大學不取錄黑人學生的決定，他會親自站在學校大門，阻止這件事發生。」他還提到：「他已經決定向聯邦政府作出挑戰。我們的州現在就要實行種族隔離，明天也要實行種族隔離，之後永遠也要實行種族隔離。」對於白人主義興盛的南部州分來說，當地居民都十分支持華萊士州長，這也間接壯大了這位鷹派州長的勢力。如果甘迺迪首先對華萊士採取過分強硬的措施，勢必影響他在南部州分的選票。
1963年6月11日，兩位名叫薇薇安馬龍和詹姆士的黑人學生認為自己受到憲法保障，有權利報讀阿拉巴馬大學，於是他們就相約這天一起到學校提交申請表。事實上，這兩位黑人學生的計劃早已經透過傳媒廣傳，就連甘迺迪也密切關注事件，他還在事前以個人的名義和詹姆士通過電話，說：「我只想告訴你，我對你現在的所作所為感到驕傲。」甘迺迪不只利用言語鼓勵詹姆士，還派出心腹司法部長聯同詹姆士兩人一起到阿拉巴馬大學進行申請。
當天，甘迺迪一直利用電視觀察着阿拉巴馬大學的現場情況。當詹姆士兩人走到大學門口時，華萊士州長果然早已站在大學門口，恭候着兩位黑人學生。這時，甘迺迪知道州長是不會動搖的，一場總統和州長的衝突勢必發生。甘迺迪總統派出的官員將政府要求阿拉巴馬大學取錄這兩位黑人學生的命令交給了州長，但州長態度堅定，而且對着傳媒表示自己會死守着大學，寸步不讓。不但如此，華萊士還召來了國民警衛軍，打算封鎖學校大廳入口，讓事件進一步升級。由於事件涉及到國民警衛軍，這明顯已經威脅到甘迺迪的管治地位，這時甘迺迪知道自己必須展示強勢。於是，他馬上下令接管華萊士的國民警衛軍，並要求國民警衛軍請華萊士離開。事實上，甘迺迪正在進行一場賭博，如果華萊士面對國民警衛軍要求也寸步不讓，美國很有可能會爆發另一場內戰。幸好，在最後一刻，華萊士州長決定讓步，1963年6月11日下午3時33分 ，美國阿拉巴馬大學迎來第一位黑人學生，意味着美國平權之路又邁進了一大步。
甘迺迪再次在博弈中獲得了勝利。甘迺迪的甘迺迪再次在博弈中獲得了勝利。甘迺迪的成功源自於他對於正義的執着和責任感，他並沒有屈服於南方權貴勢力，也沒有為了來年大選而埋沒良心，積極推動美國民主平等發展。這種傲骨和堅持，就是他能夠成為美國歷史上其中一位最偉大總統的原因。
